密義的意思就是語言之外所含之意，沒有明白地講出來，他雖然用語言來表達，但讀者卻須理解言外之意。本經既稱為「解深密」，也就是說，根據本經之所說，就能得到佛言說以外的密意。



印度佛學分三大流派，即彌勒建立的瑜伽行，以《解深密經》為其根本經典；龍樹建立的中觀，以《般若經》為其根本經典；文殊建立的瑜伽行中觀（亦即如來藏），根本的經是《入楞伽經》及《維摩經》等文殊不二法門的經典。這三系列經典，其實都含密意。

《解深密經》的結集流通是在《般若經》系列經典之後。介乎《般若經》與《解深密經》之間，還有一系列經典是以說「如來藏」為主，即是《勝鬘經》等與不二法門相應的經典。《勝鬘經》系列經典不但為了義，而且還由此開出《解深密經》一系列經典。

《般若經》的主旨是說一切法空，《勝鬘經》一系列經典所說者則是成佛的機理，且將這機理名之為「如來藏」。必須先明白這機理，然後才談得上怎樣成佛。此系列經典既說成佛的機理，當然也便說到成立眾生的機理。眾生的心識狀態恆常受貪瞋癡污染，這種狀態即名之為藏識（阿賴耶識）。正由於藏識的作用，才有六道輪迴，眾生即由是成立。

學佛的人都是眾生，佛的本懷在於教導眾生如何成佛，因此便須教導學人如何暸解自己的心識，進一步則教導學人如何清淨自己的心識，由是便有《解深密經》一系列經典。《解深密經》之所以重要，即正在於能教凡夫如何藉此而修道，從而步入成佛之道。